Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOPCQ9HD26 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms