Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms