Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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USP29Q9HBJ7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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