Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms