Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOJQ9H4E5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms