Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms