Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms