Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms