Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPERQ9BY12 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms