Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC4A5Q9BY07 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms