Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms