Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms