Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms