Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C9orf85Q96MD7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms