Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF183Q96D59 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms