Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms