Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TMIEQ8NEW7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TMIEQ8NEW7 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TMIEQ8NEW7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TMIEQ8NEW7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TMIEQ8NEW7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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