Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms