Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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TTC29Q8NA56 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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TTC29Q8NA56 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TTC29Q8NA56 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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