Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZIC4Q8N9L1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms