Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms