Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC6Q8IVU3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERC6Q8IVU3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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