Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTF1AQ7RTS3 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms