Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms