Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMBR1LQ6UX01 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms