Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 C8orf17-202ENST00000625034 2775 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms