Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A4Q6AI14 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms