Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms