Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms