Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDCCQ504Y2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms