Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP6Q16828 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP6Q16828 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP6Q16828 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP6Q16828 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms