Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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