Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLPPQ16740 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLPPQ16740 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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