Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FSCN1Q16658 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FSCN1Q16658 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms