Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms