Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms