Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms