Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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