Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SIX1Q15475 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SIX1Q15475 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SIX1Q15475 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SIX1Q15475 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SIX1Q15475 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SIX1Q15475 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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