Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SEC23BQ15437 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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SEC23BQ15437 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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SEC23BQ15437 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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SEC23BQ15437 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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SEC23BQ15437 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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