Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms