Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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