Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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ITGA9Q13797 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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ITGA9Q13797 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA9Q13797 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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