Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTCH1Q13635 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTCH1Q13635 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTCH1Q13635 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTCH1Q13635 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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