Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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