Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SCGB2A2Q13296 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SCGB2A2Q13296 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SCGB2A2Q13296 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SCGB2A2Q13296 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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SCGB2A2Q13296 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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