Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT88Q13099 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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