Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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