Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TROQ12816 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TROQ12816 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TROQ12816 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TROQ12816 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TROQ12816 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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