Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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